對于樓宇自控系統這樣一個系統工程，在我國現階段通常是由業主自己或委托監理進行系統管理的。一般業主自行制定系統的功能、定位，制定系統招標文件，設計院按業主的要求制作和提出系統初步設計方案及相關圖紙，出施工圖，供現場安裝施工，而現場的安裝施工由工程總包負責協調管理。由于我國在樓宇自控領域起步較晚，現階段此方面的人才、技術和管理的客觀實際使得樓宇自控系統的管理不可避兔地存在問題和缺陷。

1.從業主方面看，絕大多數業主缺乏相應的專業人才，對樓宇自控技術、設備和系統等方面了解不夠深入，對樓宇自控系統的定位、功能需求心中無數，有的貪大求全；對于先進技術的采用應該到什么高度，是否適合自己的現狀，各子系統間是否要集成，集成到什么程度心中沒底；對于如何從技術、商務上考慮選擇合適的設備供貨商、系統集成商缺乏經驗，招標文件及合同簽訂的不嚴密，造成糾紛；對于如何劃分業主、設計院、設備供貨商、系統集成商、安裝施工方的實施界面，難于明確各方的工作范圍及職責；對于樓宇自控系統的施工過程中出現的設計及施工上的技術問題，承包商的投機取巧，系統完成后是否完全滿足功能要求無法判斷和處理。

2.從設計方面看，由于大多數樓宇自控系統的設計往往滯后于建筑、安裝設計，在設計院進行施工圖設計時，智能系統設備尚未選型、訂貨，所以土建、安裝設計圖紙往往沒有照顧到樓宇自控系統。

3.從施工方面看，由于樓宇自控系統中各子系統較多，施工界面交叉太多，很難對施工統籌協調安排。另外智能系統設備到貨較晚，現場安裝施工早已完成了管線、接線盒的預埋，容易造成與設備供應商的要求不一致。

如上所述，當前我國樓宇自控系統的管理上依舊存在很多缺陷，這些問缺陷問題的攻克將是系統發展的一大方向。